В том и дело, что обязательство с истечением срока, предусмотренного для взыскания основной суммы долга не подлежит оплате... только для налогово инспекцЫи енто не всегда правило.... они из своей так сказать замечательной базы основную сумму не снимают, даже зачастую по решению суда (если суд указывает на пропуск срока).... обязательство у них висит отличным образом в их мудреннннной базе и пени они будут начислять и начислять.... дай Бог им здоровья... Просто так с ними разобраться самому налогоплАтельщику бывает сложнО... чаще всего через суд.... там будет выясняться, кОдЫ оплата была, когда пени стали начислять и какие меры принимала налоговая для взыскания основной задолженности.... КСтати, с Пенсионным фондом (по ИП и юр.лицам) такая жА трудность имеет место быть по задолженностям лохматых годов и начисляемым на них сумм пенЕЙ, у них такие задолженности тож перетикают из одного расчетного периОда в другой и они сами их не снимают, несмотря на невозможность взыскания...

Пени являются мерой обеспечения исполнения обязательства, следовательно, в отсутствие (по причине пропуска инспекцией 3-годичного срока давности взыскания налога) обязанности по исполнению основного обязательства (по уплате налога) обеспечение исполнения обязательства применяться не может.

есть суд. практика, лень искать...

и еще прочти внимательно п.п. 1, 5, 6 ст. 75 НК РФ и ст. 70 НК РФ