В 6-ти местных купе можно только лежать, сидеть не получится.
Я бы не обольщался и по поводу Economy Double cabin. У немцев это двухэтажный вагон с миниатюрными купе (высота потолка 1,50 м., от края полки до стенки сантиметров 45). Ехал в таком из Берлина в Париж, все проклял. Ни посидеть, ни развернуться.
А из Амстердама в Прагу летает еще KLM и CSA. Впрочем, если 50 евро за перелет для Вас дорого, вряд ли их цены устроят.