Даже доктора расходятся во мнении что лучше.

Принцип действия одинаков - антисептик.

Но. Когда моей кнопке надо было делать промывание ЛОР органов один отоларинголог из обычной муниципальной поликлиники сказал брать мирамистин - он мягче за счет синтетического способа изготовления. А вот наш семейный доктор из посольства теперь дружественного Раше государства сказала: берите хлоргексидин, он дешевле.

Имхо... тут все на ваше личное усмотрение.