Мне по работе изредка приходится вырезать лишние фрагменты из видео, или скреплять несколько видео между собой.
Для реализации такого примитивного монтажа использую Ulead VideoStudio.

Несмотря на то что я абсолютный чайник в подобных делах, результат получается очень неплохой. Плюс достаточно быстро смог разобраться в этой программе.

Она позволяет убирать аудиодорожку, осуществлять выгрузку соединенных фрагментов в один видеофайл, прямой запись на ДВД в соответствующем формате (правда этой фичей не пользовался).

По поводу айфоновских форматов сказать ничего не могу, так как являюсь идейным противником яблочных девайсов.