1. В разделе "Доходы, полученные в РФ".
2. В подразделе "Источнеги выплат" пишешь: "Продажа автомобиля . Ессно, под налог в 13%.
3. В подподразделе по месяцам и т.д. пишешь следующее:
- месяц - месяц получения бабла (если получал долями - соответственно все месяцы).
- код дохода - 1520 (выбираецца из списка - "Доходы от реализации иного имущества (доли) кроме ЦБ")
и сразу же:
- код вычета (расхода) - 907 ("Продажа имущ-ва находящ. в собст-ти 3 года и более")
- сумма вычета - в точности равная сумме дохода... можно меньше, если мазохист

КСтати сказать, в "Источнегах выплат" надо указать ВСЕ доходы, полученные за отчётный год - в т.ч. зряплату по месяцам (и подтвердить справкой 2-НДФЛ), гонорары, баблос за сдачу недвиги, за мочилово старушки процентщицы и т.д. (с копиями договоров ессно). Ну, и указывать ИНН источнегов выплат (например, зряплаты), ОКАТО всякие где положено... ну, там формы есть.

У меня заполненную этим софтом НД в налоговой взяли без замечаний, полистав минуты 2. А вручную эти их грёбаные формы имхо без привычки йопнешься заполнять... наблюдал, как там народ к инКСпектору кругами кружил...

А чо там за несвоевременную подачу декларации физиком - даже и не помню... вроде, чо-то несущественное, типа 1/365 ставки рефинансирования ЦБ за каждый день. Вот за сокрытый налог (типа сдачи хаты) - могут выипать конкретно...